主要以單細(xì)胞形式存在和繁殖的擔(dān)子菌稱為擔(dān)子菌酵母，已發(fā)現(xiàn)700余種，其中包括隱球菌和毛孢子菌(絲孢酵母)等重要的人類條件致病菌。分子系統(tǒng)學(xué)研究發(fā)現(xiàn)，擔(dān)子菌酵母并未形成一個(gè)獨(dú)立的系統(tǒng)發(fā)育類群，而是與絲狀擔(dān)子菌一起分散在傘菌亞門(Agaricomycotina)、銹菌亞門(Pucciniomycotina)和黑粉菌亞門(Ustilaginomycotina)等3個(gè)亞門的不同類群中。由于形態(tài)簡單，傳統(tǒng)上擔(dān)子菌酵母與其它酵母菌一樣，主要以生理生化等性狀為分類依據(jù)，因而形成了一套獨(dú)立于絲狀擔(dān)子菌的分類系統(tǒng)，且與絲狀真菌的分類系統(tǒng)基本不兼容。分子分類方法的應(yīng)用也顯示目前界定的許多擔(dān)子菌酵母屬及以上高等級分類單元是異源的。隨著大量新種不斷被發(fā)現(xiàn)，這些分類單元的異源性進(jìn)一步增加，愈加凸顯了現(xiàn)行擔(dān)子菌酵母分類系統(tǒng)的不合理性。
為了適應(yīng)真菌系統(tǒng)學(xué)和生物多樣性研究的發(fā)展和新命名法規(guī)的實(shí)施，迫切需要對現(xiàn)行擔(dān)子菌酵母分類系統(tǒng)進(jìn)行更新。為此，中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的白逢彥研究組與荷蘭皇家科學(xué)院(KNAW)真菌多樣性研究中心(CBS)合作，完成了絕大多數(shù)擔(dān)子菌酵母已知種的多基因序列分析，所測基因包括3個(gè)rRNA基因(18S,ITS+5.8S,26S)，3個(gè)單拷貝蛋白基因(EF-1α,RPB1,RPB2)和1個(gè)線粒體基因(CYTB)。通過整合相關(guān)絲狀擔(dān)子菌的相應(yīng)基因序列，用不同算法，包括Bayesianinference,maximumlikelihood和neighbour-joining等進(jìn)行了單基因和多基因樹構(gòu)建，比較清楚地揭示了絕大多數(shù)屬、種間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。進(jìn)而應(yīng)用數(shù)量分析方法，包括PRBO(phylogeneticrankboundaryoptimization)和GMYC(generalmixedYulecoalescent)等，對根據(jù)系統(tǒng)樹界定的目、科和屬進(jìn)行了量化評估，以檢驗(yàn)各個(gè)等級分類單元界定的合理性。再結(jié)合形態(tài)和生理生化等表型特征，并遵循“一種真菌一個(gè)名稱”的新命名法規(guī)，白逢彥實(shí)驗(yàn)室與國際同行合作，對整個(gè)擔(dān)子菌酵母和相關(guān)絲狀擔(dān)子菌的分類系統(tǒng)進(jìn)行了更新，共建立了3個(gè)新綱、3個(gè)新目、25個(gè)新科、46個(gè)新屬、1個(gè)新種名和324個(gè)新組合，并對8個(gè)原有科和37個(gè)原有屬進(jìn)行了修訂。新系統(tǒng)根據(jù)親緣關(guān)系實(shí)現(xiàn)了擔(dān)子菌酵母和絲狀擔(dān)子菌分類系統(tǒng)的有機(jī)整合，前者屬于3個(gè)亞門中的10個(gè)綱、27個(gè)目、63個(gè)科和153個(gè)屬。在這一新分類系統(tǒng)中，除少數(shù)高等級分類單元尚需加入更多絲狀擔(dān)子菌進(jìn)行更加明確的界定或調(diào)整外，大多數(shù)分類單元都已成為單系類群。
這一研究成果主要由6篇研究論文構(gòu)成，1篇于發(fā)表在Persoonia期刊上，另5篇以�？问接诎l(fā)表在StudiesinMycology期刊上。真菌學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室王啟明和劉新展為第一或共同第一作者，白逢彥和荷蘭CBS的T.Boekhout為共同通訊作者，共有來自8個(gè)國家的16位作者不同程度地參與了這一成果的合作研究、數(shù)據(jù)分析和論文寫作過程。相關(guān)研究課題先后得到了國家自然科學(xué)基金委員會杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目、重大國際合作項(xiàng)目和面上項(xiàng)目，以及荷蘭皇家科學(xué)院中荷合作項(xiàng)目等的資助。
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